一直有個漩盪已久遲遲無法解決的問題，想請教各位前輩
我寫了一隻程式（main，用c寫的，並執行於console），裡面含有我的演算法
但是在此之前，我必須要用其他人的程式
先進行抽樣（A程式），再用另外一隻程式(B程式）去進行某些運算
最後才用我在main中寫的演算法，進行最後的運算，
（所有的程式，都會持續寫入一些檔案）
由於運算是有先後順序的，因此用process的方法去控制外部程式及運算的順序，
待A及B運算完，才進行我自己的演算法
這個程式，在我只有執行一次時(one instance)，完全沒有任何問題
但是由於B程式需要耗費很久的時間才有辦法完成，因此想充分利用cpu多核的效能
所以我把程式copy到不同的目錄下，
另外又在執行了一次main，也就是我有兩個instances同時在跑，
但是發現一個很奇怪的問題，經由A程式抽樣出來的樣本在兩個目錄下完全一樣，
不論我是否刻意間隔一段時間再執行第二個instance，抽出來的結果都是一樣？？？
請問這是A程式的問題？還是其他限制？我可以切出獨立的記憶體空間，讓這兩個instances不相互干擾嗎？
還是有其他更好的解決方法？謝謝。